La intensidad de fluorescencia de cada punto (spot) del array, donde cada punto representa una sonda de ADN, ARN o proteína. El resultado es una medición masiva en paralelo de miles de interacciones en un solo soporte.

Depende de la densidad del array: los formatos comerciales actuales exigen resoluciones de pocas micras por píxel. Un escáner con resolución insuficiente mezcla señales de puntos vecinos e invalida el análisis.

Sí, en aplicaciones dirigidas: genotipificación, expresión de paneles definidos, citogenética y arrays de proteínas, donde ofrecen costo por muestra menor, flujo simple y análisis maduro. La secuenciación domina el descubrimiento; el array, la rutina dirigida.

Ambos: el array define el contenido, pero el escáner aporta el rango dinámico, la sensibilidad y la uniformidad de excitación que hacen comparables los experimentos entre sí y a lo largo del tiempo.